Impact of Emulsifiers and Thickeners in Ultra-Processed Foods on Gut Health
Programme: Subvention d'équipe : Incidence des aliments ultratransformés sur la santé
Organisme(s) subventionnaire(s): Instituts de recherche en santé du Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 mai 2026 au 30 avril 2027

GenoPhAI: Combining genomics, phenomics and artificial intelligence to facilitate and expedite the selection of superior breeding lines in soybean
Programme: Programme de partenariats pour les applications de la génomique (PPAG)
Organisme(s) subventionnaire(s): Prograin, Génome Québec, Génome Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 31 mars 2026 au 31 mars 2028

De la bouche à la maladie : l’impact des aliments ultra-transformés sur le microbiome
Programme: Faculté de médecine dentaire - Soutien financier à la recherche - Appel à projets
Organisme(s) subventionnaire(s): Université Laval - Fonds internes
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 novembre 2025 au 31 octobre 2026

Identification of objective metabolomics-based biomarkers of yogurt consumptio and characterization of thier association with type 2 diabetes incidence
Programme: Subvention à la recherche en nutrition
Organisme(s) subventionnaire(s): Les producteurs laitiers du Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 15 janvier 2025 au 31 mars 2028

Institut sur la nutrition et les aliments fonctionnels
Programme: Regroupements stratégiques NT
Organisme(s) subventionnaire(s): TransBIOTech, Université Concordia, Institut national de recherche scientifique (INRS), Université du Québec à Rimouski, Fonds de recherche du Québec - Nature et technologies, Université McGill, Université Laval - Fonds internes, Merinov - Centre d'innovation de l'aquaculture et des pêches du Québec
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2024 au 31 mars 2030

Developing mathematical and computational models to unravel the interactions between bacteria, phages and microbial metabolites
Programme: Subventions à la découverte SD (individuelles et d'équipe)
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2024 au 31 mars 2029

Financements des 2 dernières années

Soutien au développement de l'outil MeDIC (Metabolic Dashboard for Interpretable Classification)
Programme: Nouveaux Centres et Instituts de recherche - Subventions régulières
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Santé
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 30 août 2024 au 30 août 2025

Development of a computational pipeline to mine phage endolysin sequences from metagenomic detasets
Programme: Bourse de recherche Mitacs Globalink
Organisme(s) subventionnaire(s): MITACS Inc.
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 août 2024 au 30 janvier 2025

Developing mathematical and computational models to unravel the interactions between bacteria, phages, and microbial metabolites
Programme: Supplément Tremplin vers la découverte
Organisme(s) subventionnaire(s): Conseil de recherches en sciences naturelles et génie Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 avril 2024 au 31 mars 2025

Bactériophages et immunothérapie en cancer de la prostate
Programme: Nouveaux Centres et Instituts de recherche - Subventions régulières
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Santé
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 3 mai 2023 au 31 mars 2025

L'empreinte métabolomique plasmatique des produits laitiers: un reflet de leur consommation et une fenêtre sur leurs effets cardiométaboliques
Programme: Subvention à la recherche en nutrition
Organisme(s) subventionnaire(s): MITACS Inc., Les producteurs laitiers du Canada
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 janvier 2023 au 1 octobre 2025

Interrelations entre le microbiote, les bactériophages et la nutrition : élaboration d'approches en intelligence artificielle pour déterminer leurs impacts sur la santé cardiométabolique
Programme: Chercheur-boursier Juniors 1 et 2, Seniors
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Santé
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 juillet 2021 au 31 janvier 2026

Interrelations entre le microbiote, les batériophages et la nutrition: élaboration d'approches en intelligence artificielle pour déterminer leurs impacts sr la santé cardiométabolique
Programme: Établissement de jeunes chercheurs - Juniors 1
Organisme(s) subventionnaire(s): Fonds de recherche du Québec - Santé
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 juillet 2021 au 30 juin 2025

CCAI Chair - François Laviolette
Organisme(s) subventionnaire(s): Institut canadien de recherches avancées
Type de financement: Subvention
Établissement tête: Université Laval
Du 1 janvier 2020 au 31 décembre 2025

Vincent Primpied, Maîtrise en informatique - avec mémoire

Nathalie Ponton, Maîtrise en informatique - avec mémoire

Encadrements terminés dans les 5 dernières années

Fadwa Mehdaoui, Maîtrise en informatique - avec mémoire

Gnéré Mariame Coulibaly, Maîtrise en informatique - avec mémoire

Sewagnouin Rogia Kpanou, Doctorat en informatique

Rose-Marie Fortin, Maîtrise en microbiologie - avec mémoire

Alexandre Boulay, Maîtrise en biochimie - avec mémoire

Publications des 5 dernières années

Mathematical modeling of fluid dynamics in in vitro gut fermentation systems: A new tool to improve the interpretation of microbial metabolism The FASEB Journal, 2024/01/31. Jacob Lessard‐Lord, Joseph Lupien‐Meilleur, Charlène Roussel, Benjamin Gosselin‐Cliche, Cristoforo Silvestri, Vincenzo Di Marzo, Denis Roy, Elsa Rousseau, Yves Desjardins. DOI 10.1096/fj.202301739rr

Gut metagenome profile of the Nunavik Inuit youth is distinct from industrial and non-industrial counterparts Communications Biology, 2022/12/24. Jehane Y. Abed, Thibaud Godon, Fadwa Mehdaoui, Pier-Luc Plante, Maurice Boissinot, Michel G. Bergeron, Richard E. Bélanger, Gina Muckle, Natalia Poliakova, Pierre Ayotte, Jacques Corbeil, Elsa Rousseau. DOI 10.1038/s42003-022-04372-y

A defective viral genome strategy elicits broad protective immunity against respiratory viruses Cell, 2021/12. Yinghong Xiao, Peter V. Lidsky, Yuta Shirogane, Ranen Aviner, Chien-Ting Wu, Weiyi Li, Weihao Zheng, Dale Talbot, Adam Catching, Gilad Doitsh, Weiheng Su, Colby E. Gekko, Arabinda Nayak, Joel D. Ernst, Leonid Brodsky, Elia Brodsky, Elsa Rousseau, Sara Capponi, Simone Bianco, Robert Nakamura, Peter K. Jackson, Judith Frydman, Raul Andino. DOI 10.1016/j.cell.2021.11.023

Experimental and mathematical insights on the interactions between poliovirus and a defective interfering genome PLOS Pathogens, 2021/09/27. DOI 10.1371/journal.ppat.1009277